Шан Цзун, вероломный колдун при дворе Шао Кана, после поглощения его души Императором Внешнего Мира, перерождается в мире Наруто. Теперь он носит имя Какаси Сяринган и является почти обычным дзёнином синоби, с той лишь разницей, что он сохранил свою магию. События стартуют с "экзамена двух колокольчиков".