Мотоко Кусанаги — Майор 9-го Отдела МВД Японии. Высокотехнологичный киборг с полностью синтетическим телом. После неудачной операции по предотвращению террористической атаки Мотоко просыпается в незнакомом месте и обнаруживает, что она не единственная, кто туда попал. Ей предстоит найти ответы на важные вопросы, чтобы выжить в мире, захваченном машинами.