Заснув на борту «Звёздного экспресса», Кэлус просыпается в Фуюки — городе, где начинается новая Война Святого Грааля. Чтобы вернуться домой, ему предстоит стать Мастером, заключить союз с загадочной Лансер и разобраться, почему в этом мире появляются люди, которых он уже встречал… но прожившие совсем другую жизнь.