Прошёл год после событий игры Tomb Raider: Underworld. Лара Крофт решает "завязать" с археологией и поиском древних артефактов и ведёт уединенный образ жизни. Она живёт в Англии со своим помощником и другом Зипом, и Уинстоном, фамильным дворецким, а также читает лекции в университетах разных стран. Однажды ей на почту приходит письмо с предложением о сотрудничестве с организацией, противостоящей биотерроризму. Ларе ничего не остаётся, как согласиться на эту сделку...