После того, как Шепард выстрелила в катализатор, она приходит в себя на планете BG-386 и оказывается в эпицентре сражения людей, хищников и чужих. Какую сторону выберет Шепард и удастся ли ей вернуться обратно к своей команде, считающей её погибшей?